20
30
40
50 60
KOD
APGVLTQVYGPYASGKT-------TLALQTGLLS---GKKVAYVDTEGGFSPERLVQMAE
Ecoli
PMGRIVEIYGPESSGKT-------TLTLQVIAAAQREGKTCAFIDAEHALDPIYARKLG-
70
80
90
100
110 120
KOD
TRGLNPEEALSRFILFTPSDFKEQRRVIGSLKKTVDSN---FALVVVDSITAHY-RAEEN
Ecoli
-------VDIDNLLCSQPDTGEQALEICDALARSGA-----VDVIVVDSVAALTPKAEIE
130
140
150 160
KOD
RSG-------LIAELSRQLQVLLWIARKHNIPVIVINQVHFDSRTEM-------TKPVAE
Ecoli
GEIGDSHMGLAARMMSQAMRKLAGNLKQSNTLLIFINQIRMKIGVMFG----NPETTTGG
170
180
190
200 210
KOD
QTLGYRCKDILRLDKL----------PKPGLRVAVLERHRFRPEA---LWHISG------
Ecoli
NALKFYASVRLDIRRIGAVKEGEN-V-VGSETRVKVVKNKIAAPFKQAEFQILYGEGINF
Ecoli YGELVDLGVKEKLIEKAGAWYSYKGEKIGQGKANATAWLKDNPETAKEIEKKVRELLLSN
Ecoli PN---STPDFSVDDSEGVAETNEDF-----------------------------------
P.kodakaraensis KOD1由来RecAホモログ(KOD)とE.coli
RecA(Ecoli)のアミノ酸配列の比較。KOD1由来RecAホモログは210アミノ酸残基からなり、352アミノ酸残基からなるE.coli
RecAと比べるとN末端とC末端が大きく欠失していることがわかる。