10
KOD             ------------------------------------------MLSTGTKSLDSLLG-GGF
Ecoli           ---AIDENKQKALAAALGQIEKQFGKGSIMRLG-EDRSMDVETISTGSLSLDIALGAGGL

                  20         30             40          50        60
KOD             APGVLTQVYGPYASGKT-------TLALQTGLLS---GKKVAYVDTEGGFSPERLVQMAE
Ecoli           PMGRIVEIYGPESSGKT-------TLTLQVIAAAQREGKTCAFIDAEHALDPIYARKLG-

                  70         80         90       100        110         120
KOD             TRGLNPEEALSRFILFTPSDFKEQRRVIGSLKKTVDSN---FALVVVDSITAHY-RAEEN
Ecoli           -------VDIDNLLCSQPDTGEQALEICDALARSGA-----VDVIVVDSVAALTPKAEIE

                          130        140        150        160
KOD             RSG-------LIAELSRQLQVLLWIARKHNIPVIVINQVHFDSRTEM-------TKPVAE
Ecoli           GEIGDSHMGLAARMMSQAMRKLAGNLKQSNTLLIFINQIRMKIGVMFG----NPETTTGG

                  170        180          190       200         210
KOD             QTLGYRCKDILRLDKL----------PKPGLRVAVLERHRFRPEA---LWHISG------
Ecoli           NALKFYASVRLDIRRIGAVKEGEN-V-VGSETRVKVVKNKIAAPFKQAEFQILYGEGINF

Ecoli           YGELVDLGVKEKLIEKAGAWYSYKGEKIGQGKANATAWLKDNPETAKEIEKKVRELLLSN

Ecoli           PN---STPDFSVDDSEGVAETNEDF-----------------------------------

P.kodakaraensis KOD1由来RecAホモログ(KOD)とE.coli RecA(Ecoli)のアミノ酸配列の比較。KOD1由来RecAホモログは210アミノ酸残基からなり、352アミノ酸残基からなるE.coli RecAと比べるとN末端とC末端が大きく欠失していることがわかる。
 
 

Back